استقلال در دهه سوم اردیبهشت ماه سال ۹۱ روزهای پرتلاطمی را سپری می‌کرد به خاطر اینکه بازیکنان در اعتراض به عدم دریافت به‌موقع مطالبات خود حاضر به تمرین نشدند و اعتصاب کردند. در آن مقطع از مجتبی جباری به عنوان سردسته اصلی بازیکنان برای اعتصاب یاد می‌شد و همین مسئله اعتراض تند علی فتح‌الله‌زاده را در پی داشت.
مدیرعامل وقت استقلال طی مصاحبه‌ای که ۲۴ اردیبهشت سال ۹۱ در خبرورزشی منتشر شد با انتقاد شدید از مجتبی جباری گفت: جباری در حالی تمرین را به هم ریخته که امسال همه پولش را دریافت کرده و طلب سال قبل را هم به او داده‌ایم. فقط ۱۷۰میلیون تومان از زمان واعظ آشتیانی باقی مانده که هنوز پرداخت نکرده‌ایم. از بس که باشگاه لیلی به لالای او گذاشته هر تصمیمی که دلش می‌خواهد می‌گیرد ولی این بار استقلال هم او را جریمه سنگین خواهد کرد. این دفعه مجتبی را به کمیته انضباطی فدراسیون فوتبال ارجاع می‌دهیم تا در موردش تصمیم بگیرند. کاسه صبر من دیگر لبریز شده است! جباری عامل تعطیلی تمرین بود و با توجه به اغتشاشی که انجام داده است باید چند سال محروم شود. این بار دیگر کوتاه نمی‌آییم. از توپ گرفته تا مربی از دست او در امان نیستند!
نکته اینکه داستان مجتبی جباری با استقلال در آن مقطع خیلی زود حل شد و او فصل بعد نیز پیراهن آبی را بر تن کرده و همراه با استقلال قهرمان لیگ برتر شد.
