استقلال در اواخر بهار سال ۱۳۸۸ پس از جدایی امیر قلعه‌نویی، حکم سرمربیگری این تیم برای لیگ نهم را به نام صمد مرفاوی زد و این مسابقات از مرداد ۸۸ شروع شد.
وقتی مرفاوی هدایت استقلال را بر عهده گرفت، شایعات فراوانی پیرامون دودستگی میان طرفداران استقلال و برخی اتفاقات روی سکوها مطرح شد. در این میان ۲۱ شهریور سال ۸۸ مدیران وقت باشگاه استقلال مدعی شدند در تحقیقات خود به مستنداتی دست یافته‌اند که نشان می‌دهد برخی افراد با نیت خاصی به چند نفر از لیدرها و بوقچی‌های استقلال پول داده‌اند تا علیه صمد مرفاوی در دیدارهای خانگی این تیم شعار داده شود!
اتفاقاً در همین روز امیر قلعه‌نویی، سرمربی اسبق استقلال که پس از جدایی اصلا رابطه گرمی با مدیران آن زمان استقلال نداشت، مصاحبه‌ای جالب کرد و در واکنش به شرایط این تیم گفت: نمی‌خواهم وارد ماجراهای استقلال و همین داستان مطرح‌شده پیرامون پرداخت پول به برخی افراد بشوم اما فقط همین‌قدر به شما بگویم که هواداران استقلال آگاه هستند و دروغ‌گوها را به خوبی می‌شناسند.
البته اسناد ادعاشده توسط استقلالی‌ها هرگز در اختیار رسانه‌ها قرار نگرفت ولی امیررضا واعظی آشتیانی مدیرعامل آن مقطع استقلال بارها در مصاحبه‌های خود وقوع چنین اتفاقی را تایید کرد.
