«محمد مهاجری» روزنامه نگار و فعال سیاسی اصولگرا در توئیتی نوشته بود: «جناب آقای قالیباف! مرکز پژوهش‌های مجلس یازدهم به ریاست آقای علی زاکانی با اینکه حداکثر ۲۴۸ پست سازمانی دارد در چندماه اخیر به ۶۰۰ نفرحقوق ثابت و به افراد متعددی بابت پروژه‌های مثلا تحقیقاتی پول داده و میلیارد‌ها تومان سرمایه ملت بر باد رفته. یکی از نتایج این همه ریخت و پاش برای پژوهش همین قانون بودجه ۱۴۰۰ شماست که با ۱۲۰ ایراد از شورای نگهبان برگشت خورده. مراتب به عرض رسید تا اگر عیسی شریفی دیگری درست شد نگویید بی خبر بودم.»

علیرضا زاکانی نماینده قم در مجلس یازدهم و رئیس مرکز پژوهش‌های مجلس در پاسخ به محمد مهاجری در صفحه توئیترش نوشت: تازه کاری راه شهرت یافتنش رونجس کردن چشمه ده دید که البته همزمان معروف شد و بی آبرو. حکایت ما با آقای محمد مهاجری هم اینه، بزرگوار اگر علاقه داری دیده بشی چرا سراغ مرکز پژوهش‌های مجلس آمدی و حرف بی حساب زدی، یا عدد‌ها را نمی‌دانی یا معنی فیش یا مغازه رو. یک ادعایت درست نبود.