براساس نتایج یک نظرسنجی در سال ۱۳۸۳، مهرجویی با آفریدن هفت شخصیت، بیشترین شخصیت سینمایی ماندگار را در سینمای ایران خلق کرده است. همچنین، شخصیت هامون در فیلمی به همین نام از مهرجویی، ماندگارترین شخصیت در تاریخ سینمای ایران دانسته شده است. از آثار مهم مهرجویی می‌توان به فیلم‌های گاو، اجاره‌نشین‌ها، هامون، سارا، پری، لیلا، درخت گلابی و مهمان مامان اشاره کرد. مهرجویی و همسرش، وحیده محمدی‌فر، شب ۲۲ مهر ۱۴۰۲ در خانه ویلایی خود در مشکین‌دشت کرج کُشته شدند. دخترشان جسد آنها را کشف کرد و ماجرا را به پلیس گزارش داد. پیش از این حادثه، محمدی‌فر در صفحه شخصی خود در شبکه‌های اجتماعی از تهدیدهای شخصی ناشناس با چاقو از پشت درِ ویلا خبر داده بود. او همچنین در این پست در صفحه اینستاگرام خود نوشته بود در هفته‌های اخیر مورد سرقت قرار گرفتند و دو سنتور مربوط به پروژه سنتوری ۲ از او دزدیده شده بود. خبر کشته شدن مهرجویی و همسرش در ساعات اولیه بامداد ۲۳ مهر اعلام و از طرف نشریات پوشش داده شد. به مناسبت مرگ مهرجویی، خانه سینمای ایران سه روز عزای عمومی اعلام کرد و شبکه نمایش و رادیو نمایش از ۲۹ مهر تا ۵ آبان مرور فیلم‌های او را در برنامه قرار دادند.
